Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTF4P34130 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTF4P34130 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTF4P34130 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTF4P34130 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTF4P34130 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTF4P34130 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTF4P34130 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTF4P34130 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTF4P34130 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF4P34130 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF4P34130 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF4P34130 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF4P34130 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF4P34130 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF4P34130 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF4P34130 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF4P34130 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF4P34130 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF4P34130 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF4P34130 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF4P34130 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF4P34130 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF4P34130 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF4P34130 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF4P34130 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF4P34130 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF4P34130 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF4P34130 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF4P34130 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF4P34130 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF4P34130 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF4P34130 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF4P34130 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF4P34130 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF4P34130 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF4P34130 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF4P34130 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF4P34130 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF4P34130 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF4P34130 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF4P34130 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF4P34130 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF4P34130 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF4P34130 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF4P34130 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF4P34130 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF4P34130 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF4P34130 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF4P34130 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF4P34130 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF4P34130 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF4P34130 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF4P34130 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF4P34130 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF4P34130 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF4P34130 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF4P34130 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF4P34130 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF4P34130 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF4P34130 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF4P34130 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF4P34130 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF4P34130 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF4P34130 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF4P34130 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTF4P34130 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTF4P34130 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTF4P34130 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTF4P34130 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTF4P34130 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms