Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG3P32926 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG3P32926 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG3P32926 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG3P32926 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG3P32926 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG3P32926 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG3P32926 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG3P32926 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG3P32926 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG3P32926 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG3P32926 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG3P32926 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG3P32926 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG3P32926 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG3P32926 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG3P32926 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG3P32926 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG3P32926 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG3P32926 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG3P32926 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG3P32926 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG3P32926 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG3P32926 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG3P32926 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG3P32926 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG3P32926 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG3P32926 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG3P32926 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG3P32926 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG3P32926 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG3P32926 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG3P32926 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG3P32926 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG3P32926 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG3P32926 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG3P32926 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG3P32926 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG3P32926 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG3P32926 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG3P32926 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG3P32926 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG3P32926 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG3P32926 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG3P32926 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG3P32926 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG3P32926 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG3P32926 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG3P32926 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSG3P32926 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSG3P32926 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSG3P32926 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSG3P32926 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSG3P32926 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSG3P32926 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSG3P32926 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DSG3P32926 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSG3P32926 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DSG3P32926 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSG3P32926 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSG3P32926 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DSG3P32926 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSG3P32926 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSG3P32926 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSG3P32926 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSG3P32926 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DSG3P32926 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG3P32926 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG3P32926 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG3P32926 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG3P32926 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG3P32926 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG3P32926 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG3P32926 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG3P32926 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG3P32926 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG3P32926 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG3P32926 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG3P32926 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG3P32926 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG3P32926 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG3P32926 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG3P32926 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG3P32926 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG3P32926 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG3P32926 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DSG3P32926 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DSG3P32926 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DSG3P32926 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DSG3P32926 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DSG3P32926 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DSG3P32926 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DSG3P32926 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DSG3P32926 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DSG3P32926 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DSG3P32926 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG3P32926 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG3P32926 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG3P32926 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG3P32926 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms