Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBP2P32456 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBP2P32456 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBP2P32456 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBP2P32456 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBP2P32456 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBP2P32456 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBP2P32456 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBP2P32456 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBP2P32456 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBP2P32456 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBP2P32456 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBP2P32456 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBP2P32456 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBP2P32456 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBP2P32456 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBP2P32456 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBP2P32456 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBP2P32456 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBP2P32456 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBP2P32456 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBP2P32456 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBP2P32456 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBP2P32456 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBP2P32456 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBP2P32456 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBP2P32456 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBP2P32456 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBP2P32456 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBP2P32456 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GBP2P32456 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBP2P32456 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBP2P32456 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBP2P32456 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBP2P32456 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBP2P32456 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBP2P32456 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBP2P32456 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GBP2P32456 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBP2P32456 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBP2P32456 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBP2P32456 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBP2P32456 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBP2P32456 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GBP2P32456 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBP2P32456 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GBP2P32456 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GBP2P32456 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GBP2P32456 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GBP2P32456 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GBP2P32456 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBP2P32456 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GBP2P32456 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBP2P32456 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBP2P32456 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBP2P32456 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBP2P32456 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBP2P32456 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBP2P32456 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBP2P32456 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GBP2P32456 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBP2P32456 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBP2P32456 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBP2P32456 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBP2P32456 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBP2P32456 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBP2P32456 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBP2P32456 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBP2P32456 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBP2P32456 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBP2P32456 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBP2P32456 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBP2P32456 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP2P32456 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP2P32456 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP2P32456 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP2P32456 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP2P32456 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP2P32456 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP2P32456 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP2P32456 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP2P32456 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP2P32456 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP2P32456 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP2P32456 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP2P32456 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP2P32456 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP2P32456 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP2P32456 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP2P32456 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP2P32456 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP2P32456 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP2P32456 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBP2P32456 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP2P32456 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP2P32456 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP2P32456 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP2P32456 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP2P32456 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBP2P32456 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms