Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA13P31271 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms