Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms