Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTR2AP28223 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms