Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms