Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms