Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO1P25800 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO1P25800 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO1P25800 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO1P25800 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO1P25800 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO1P25800 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO1P25800 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO1P25800 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO1P25800 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO1P25800 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO1P25800 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO1P25800 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO1P25800 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LMO1P25800 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LMO1P25800 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LMO1P25800 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO1P25800 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO1P25800 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO1P25800 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO1P25800 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO1P25800 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO1P25800 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO1P25800 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO1P25800 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO1P25800 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO1P25800 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO1P25800 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO1P25800 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO1P25800 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO1P25800 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO1P25800 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO1P25800 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO1P25800 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO1P25800 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO1P25800 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO1P25800 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO1P25800 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO1P25800 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO1P25800 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO1P25800 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO1P25800 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO1P25800 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO1P25800 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO1P25800 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO1P25800 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMO1P25800 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms