Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRGP23470 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms