Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHCGRP22888 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHCGRP22888 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHCGRP22888 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHCGRP22888 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHCGRP22888 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHCGRP22888 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LHCGRP22888 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LHCGRP22888 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LHCGRP22888 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LHCGRP22888 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LHCGRP22888 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LHCGRP22888 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHCGRP22888 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms