Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALB2P22676 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALB2P22676 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALB2P22676 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALB2P22676 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALB2P22676 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALB2P22676 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALB2P22676 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALB2P22676 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CALB2P22676 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALB2P22676 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALB2P22676 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALB2P22676 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CALB2P22676 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALB2P22676 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALB2P22676 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALB2P22676 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALB2P22676 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALB2P22676 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALB2P22676 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALB2P22676 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CALB2P22676 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CALB2P22676 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CALB2P22676 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CALB2P22676 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CALB2P22676 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CALB2P22676 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALB2P22676 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALB2P22676 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALB2P22676 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALB2P22676 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CALB2P22676 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CALB2P22676 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALB2P22676 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALB2P22676 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALB2P22676 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALB2P22676 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALB2P22676 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALB2P22676 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALB2P22676 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALB2P22676 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALB2P22676 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALB2P22676 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALB2P22676 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALB2P22676 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALB2P22676 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALB2P22676 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALB2P22676 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALB2P22676 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALB2P22676 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALB2P22676 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALB2P22676 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALB2P22676 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALB2P22676 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CALB2P22676 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALB2P22676 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALB2P22676 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CALB2P22676 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CALB2P22676 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALB2P22676 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CALB2P22676 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALB2P22676 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CALB2P22676 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALB2P22676 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CALB2P22676 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALB2P22676 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CALB2P22676 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALB2P22676 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALB2P22676 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CALB2P22676 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CALB2P22676 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CALB2P22676 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CALB2P22676 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CALB2P22676 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALB2P22676 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CALB2P22676 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALB2P22676 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CALB2P22676 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CALB2P22676 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms