Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGFR4P22455 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGFR4P22455 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms