Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms