Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CREB1P16220 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CREB1P16220 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CREB1P16220 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CREB1P16220 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CREB1P16220 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CREB1P16220 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CREB1P16220 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CREB1P16220 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CREB1P16220 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CREB1P16220 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CREB1P16220 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CREB1P16220 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CREB1P16220 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CREB1P16220 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CREB1P16220 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CREB1P16220 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CREB1P16220 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CREB1P16220 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CREB1P16220 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CREB1P16220 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB1P16220 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB1P16220 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB1P16220 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB1P16220 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB1P16220 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB1P16220 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB1P16220 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB1P16220 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB1P16220 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB1P16220 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB1P16220 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB1P16220 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB1P16220 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB1P16220 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB1P16220 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB1P16220 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB1P16220 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB1P16220 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB1P16220 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB1P16220 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB1P16220 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB1P16220 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB1P16220 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB1P16220 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB1P16220 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CREB1P16220 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB1P16220 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB1P16220 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB1P16220 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB1P16220 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB1P16220 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB1P16220 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB1P16220 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB1P16220 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB1P16220 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB1P16220 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB1P16220 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB1P16220 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB1P16220 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB1P16220 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB1P16220 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB1P16220 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB1P16220 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB1P16220 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB1P16220 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB1P16220 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB1P16220 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB1P16220 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB1P16220 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB1P16220 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB1P16220 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB1P16220 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB1P16220 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB1P16220 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CREB1P16220 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CREB1P16220 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CREB1P16220 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CREB1P16220 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CREB1P16220 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CREB1P16220 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CREB1P16220 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CREB1P16220 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CREB1P16220 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CREB1P16220 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CREB1P16220 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CREB1P16220 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CREB1P16220 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CREB1P16220 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB1P16220 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB1P16220 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB1P16220 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB1P16220 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB1P16220 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB1P16220 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB1P16220 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB1P16220 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB1P16220 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB1P16220 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CREB1P16220 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms