Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms