Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms