Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CFTRP13569 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CFTRP13569 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CFTRP13569 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CFTRP13569 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CFTRP13569 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CFTRP13569 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CFTRP13569 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CFTRP13569 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CFTRP13569 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CFTRP13569 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC33.76■■■■□ 3
CFTRP13569 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
CFTRP13569 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
CFTRP13569 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC33.76■■■■□ 3
CFTRP13569 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CFTRP13569 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CFTRP13569 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CFTRP13569 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CFTRP13569 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CFTRP13569 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CFTRP13569 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CFTRP13569 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CFTRP13569 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CFTRP13569 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
CFTRP13569 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CFTRP13569 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CFTRP13569 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CFTRP13569 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CFTRP13569 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CFTRP13569 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CFTRP13569 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CFTRP13569 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CFTRP13569 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CFTRP13569 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CFTRP13569 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CFTRP13569 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CFTRP13569 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CFTRP13569 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CFTRP13569 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CFTRP13569 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CFTRP13569 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CFTRP13569 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CFTRP13569 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CFTRP13569 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CFTRP13569 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CFTRP13569 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CFTRP13569 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CFTRP13569 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CFTRP13569 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CFTRP13569 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CFTRP13569 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CFTRP13569 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CFTRP13569 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CFTRP13569 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CFTRP13569 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CFTRP13569 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CFTRP13569 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CFTRP13569 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFTRP13569 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFTRP13569 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFTRP13569 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFTRP13569 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFTRP13569 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFTRP13569 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFTRP13569 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFTRP13569 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFTRP13569 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFTRP13569 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFTRP13569 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFTRP13569 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFTRP13569 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFTRP13569 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFTRP13569 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CFTRP13569 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CFTRP13569 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CFTRP13569 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CFTRP13569 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CFTRP13569 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CFTRP13569 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CFTRP13569 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CFTRP13569 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CFTRP13569 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CFTRP13569 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CFTRP13569 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CFTRP13569 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CFTRP13569 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CFTRP13569 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CFTRP13569 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CFTRP13569 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CFTRP13569 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CFTRP13569 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CFTRP13569 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CFTRP13569 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CFTRP13569 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CFTRP13569 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CFTRP13569 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CFTRP13569 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CFTRP13569 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CFTRP13569 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CFTRP13569 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms