Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1P11387 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1P11387 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1P11387 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1P11387 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1P11387 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1P11387 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1P11387 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1P11387 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1P11387 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1P11387 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1P11387 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1P11387 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1P11387 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1P11387 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1P11387 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1P11387 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1P11387 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1P11387 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1P11387 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1P11387 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1P11387 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1P11387 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1P11387 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP1P11387 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1P11387 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1P11387 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1P11387 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1P11387 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1P11387 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1P11387 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1P11387 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1P11387 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1P11387 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1P11387 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1P11387 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1P11387 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1P11387 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1P11387 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1P11387 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1P11387 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1P11387 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1P11387 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1P11387 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1P11387 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1P11387 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1P11387 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1P11387 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1P11387 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TOP1P11387 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1P11387 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1P11387 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1P11387 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1P11387 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1P11387 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1P11387 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1P11387 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1P11387 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1P11387 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1P11387 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1P11387 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1P11387 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1P11387 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1P11387 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1P11387 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1P11387 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1P11387 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1P11387 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP1P11387 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1P11387 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1P11387 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1P11387 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1P11387 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1P11387 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1P11387 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1P11387 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1P11387 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1P11387 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1P11387 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1P11387 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1P11387 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1P11387 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1P11387 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1P11387 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1P11387 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1P11387 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1P11387 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1P11387 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1P11387 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1P11387 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP1P11387 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1P11387 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1P11387 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1P11387 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1P11387 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1P11387 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1P11387 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1P11387 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1P11387 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1P11387 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms