Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PF4V1P10720 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms