Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHGAP10645 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHGAP10645 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHGAP10645 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHGAP10645 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CHGAP10645 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHGAP10645 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHGAP10645 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHGAP10645 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHGAP10645 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHGAP10645 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHGAP10645 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHGAP10645 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHGAP10645 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHGAP10645 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHGAP10645 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHGAP10645 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHGAP10645 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHGAP10645 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHGAP10645 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHGAP10645 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHGAP10645 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHGAP10645 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CHGAP10645 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CHGAP10645 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHGAP10645 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHGAP10645 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHGAP10645 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CHGAP10645 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHGAP10645 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHGAP10645 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHGAP10645 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHGAP10645 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHGAP10645 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHGAP10645 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHGAP10645 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHGAP10645 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHGAP10645 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CHGAP10645 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHGAP10645 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CHGAP10645 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CHGAP10645 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHGAP10645 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHGAP10645 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHGAP10645 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHGAP10645 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHGAP10645 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHGAP10645 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHGAP10645 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHGAP10645 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHGAP10645 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHGAP10645 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHGAP10645 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHGAP10645 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CHGAP10645 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CHGAP10645 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHGAP10645 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHGAP10645 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CHGAP10645 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHGAP10645 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHGAP10645 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHGAP10645 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHGAP10645 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHGAP10645 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHGAP10645 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHGAP10645 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHGAP10645 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHGAP10645 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHGAP10645 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHGAP10645 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHGAP10645 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHGAP10645 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHGAP10645 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHGAP10645 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHGAP10645 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHGAP10645 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHGAP10645 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHGAP10645 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHGAP10645 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHGAP10645 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHGAP10645 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHGAP10645 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHGAP10645 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHGAP10645 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHGAP10645 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHGAP10645 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHGAP10645 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CHGAP10645 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CHGAP10645 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CHGAP10645 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHGAP10645 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CHGAP10645 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHGAP10645 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHGAP10645 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHGAP10645 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHGAP10645 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHGAP10645 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CHGAP10645 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHGAP10645 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CHGAP10645 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms