Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB1P08034 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB1P08034 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB1P08034 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB1P08034 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB1P08034 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB1P08034 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB1P08034 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB1P08034 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB1P08034 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB1P08034 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB1P08034 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB1P08034 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB1P08034 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB1P08034 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB1P08034 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB1P08034 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB1P08034 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB1P08034 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GJB1P08034 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GJB1P08034 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB1P08034 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB1P08034 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB1P08034 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB1P08034 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB1P08034 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB1P08034 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB1P08034 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB1P08034 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB1P08034 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB1P08034 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB1P08034 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB1P08034 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB1P08034 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB1P08034 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB1P08034 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB1P08034 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB1P08034 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB1P08034 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB1P08034 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB1P08034 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB1P08034 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB1P08034 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB1P08034 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB1P08034 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB1P08034 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB1P08034 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB1P08034 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB1P08034 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB1P08034 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB1P08034 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB1P08034 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB1P08034 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB1P08034 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB1P08034 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB1P08034 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB1P08034 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB1P08034 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB1P08034 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB1P08034 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB1P08034 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB1P08034 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB1P08034 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB1P08034 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB1P08034 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB1P08034 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB1P08034 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB1P08034 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB1P08034 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB1P08034 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB1P08034 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB1P08034 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB1P08034 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB1P08034 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB1P08034 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB1P08034 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB1P08034 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB1P08034 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB1P08034 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB1P08034 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB1P08034 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB1P08034 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB1P08034 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB1P08034 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB1P08034 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB1P08034 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB1P08034 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB1P08034 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB1P08034 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB1P08034 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB1P08034 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB1P08034 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB1P08034 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB1P08034 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB1P08034 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB1P08034 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB1P08034 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB1P08034 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB1P08034 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB1P08034 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms