Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTMAP06454 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTMAP06454 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTMAP06454 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTMAP06454 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTMAP06454 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTMAP06454 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTMAP06454 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTMAP06454 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTMAP06454 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTMAP06454 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTMAP06454 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTMAP06454 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTMAP06454 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTMAP06454 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTMAP06454 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTMAP06454 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTMAP06454 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTMAP06454 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTMAP06454 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTMAP06454 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTMAP06454 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTMAP06454 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTMAP06454 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTMAP06454 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTMAP06454 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTMAP06454 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTMAP06454 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTMAP06454 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTMAP06454 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTMAP06454 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTMAP06454 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTMAP06454 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTMAP06454 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTMAP06454 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTMAP06454 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTMAP06454 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTMAP06454 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTMAP06454 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTMAP06454 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTMAP06454 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTMAP06454 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTMAP06454 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTMAP06454 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTMAP06454 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTMAP06454 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTMAP06454 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTMAP06454 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTMAP06454 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTMAP06454 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTMAP06454 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTMAP06454 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTMAP06454 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTMAP06454 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTMAP06454 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTMAP06454 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTMAP06454 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTMAP06454 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTMAP06454 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTMAP06454 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTMAP06454 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTMAP06454 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTMAP06454 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTMAP06454 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTMAP06454 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTMAP06454 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTMAP06454 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTMAP06454 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTMAP06454 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTMAP06454 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTMAP06454 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTMAP06454 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTMAP06454 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTMAP06454 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTMAP06454 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTMAP06454 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTMAP06454 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTMAP06454 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTMAP06454 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTMAP06454 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTMAP06454 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTMAP06454 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTMAP06454 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTMAP06454 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTMAP06454 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTMAP06454 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTMAP06454 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTMAP06454 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTMAP06454 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTMAP06454 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTMAP06454 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTMAP06454 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTMAP06454 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTMAP06454 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTMAP06454 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTMAP06454 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTMAP06454 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTMAP06454 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTMAP06454 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTMAP06454 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms