Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDNEP1O95476 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1O95476 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms