Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCB11O95342 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms