Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms