Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNSO60931 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNSO60931 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNSO60931 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNSO60931 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNSO60931 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNSO60931 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNSO60931 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNSO60931 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNSO60931 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNSO60931 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNSO60931 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNSO60931 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNSO60931 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNSO60931 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNSO60931 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNSO60931 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNSO60931 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNSO60931 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNSO60931 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNSO60931 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNSO60931 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNSO60931 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNSO60931 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNSO60931 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNSO60931 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNSO60931 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNSO60931 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNSO60931 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTNSO60931 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNSO60931 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNSO60931 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNSO60931 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNSO60931 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNSO60931 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNSO60931 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNSO60931 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNSO60931 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNSO60931 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNSO60931 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNSO60931 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNSO60931 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNSO60931 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNSO60931 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNSO60931 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNSO60931 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNSO60931 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNSO60931 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNSO60931 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNSO60931 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNSO60931 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNSO60931 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNSO60931 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNSO60931 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNSO60931 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNSO60931 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNSO60931 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNSO60931 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTNSO60931 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNSO60931 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNSO60931 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNSO60931 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNSO60931 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNSO60931 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNSO60931 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNSO60931 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNSO60931 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNSO60931 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNSO60931 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNSO60931 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNSO60931 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNSO60931 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNSO60931 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNSO60931 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNSO60931 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNSO60931 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNSO60931 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNSO60931 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNSO60931 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNSO60931 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNSO60931 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNSO60931 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNSO60931 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNSO60931 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNSO60931 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNSO60931 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNSO60931 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNSO60931 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNSO60931 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNSO60931 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNSO60931 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNSO60931 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNSO60931 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNSO60931 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNSO60931 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNSO60931 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNSO60931 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNSO60931 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNSO60931 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNSO60931 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms