Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC39.17■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC39.13■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC39.12■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC39.11■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC39.1■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC39.1■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms