Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLIN1O60240 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms