Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR3O43761 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms