Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX6O43752 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX6O43752 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX6O43752 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX6O43752 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX6O43752 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX6O43752 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX6O43752 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX6O43752 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX6O43752 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STX6O43752 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX6O43752 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX6O43752 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX6O43752 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX6O43752 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX6O43752 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX6O43752 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX6O43752 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX6O43752 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX6O43752 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX6O43752 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX6O43752 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX6O43752 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX6O43752 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX6O43752 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX6O43752 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX6O43752 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX6O43752 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX6O43752 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STX6O43752 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX6O43752 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX6O43752 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX6O43752 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX6O43752 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX6O43752 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX6O43752 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX6O43752 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX6O43752 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX6O43752 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX6O43752 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX6O43752 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX6O43752 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX6O43752 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX6O43752 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX6O43752 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX6O43752 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX6O43752 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX6O43752 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX6O43752 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX6O43752 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STX6O43752 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX6O43752 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX6O43752 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX6O43752 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX6O43752 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX6O43752 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX6O43752 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX6O43752 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX6O43752 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX6O43752 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX6O43752 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX6O43752 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX6O43752 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX6O43752 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX6O43752 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX6O43752 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX6O43752 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX6O43752 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX6O43752 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX6O43752 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX6O43752 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX6O43752 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX6O43752 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX6O43752 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX6O43752 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX6O43752 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
STX6O43752 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX6O43752 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX6O43752 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX6O43752 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX6O43752 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX6O43752 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX6O43752 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
STX6O43752 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX6O43752 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX6O43752 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX6O43752 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX6O43752 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX6O43752 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX6O43752 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX6O43752 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX6O43752 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX6O43752 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX6O43752 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX6O43752 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX6O43752 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STX6O43752 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STX6O43752 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX6O43752 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX6O43752 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms