Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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