Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPAA1O43292 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPAA1O43292 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPAA1O43292 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPAA1O43292 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPAA1O43292 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GPAA1O43292 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GPAA1O43292 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPAA1O43292 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPAA1O43292 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPAA1O43292 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPAA1O43292 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPAA1O43292 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms