Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLOCKO15516 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms