Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMA5O15230 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA5O15230 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA5O15230 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA5O15230 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA5O15230 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA5O15230 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA5O15230 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA5O15230 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA5O15230 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA5O15230 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA5O15230 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMA5O15230 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms