Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGRNO00468 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGRNO00468 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGRNO00468 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGRNO00468 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGRNO00468 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGRNO00468 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGRNO00468 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGRNO00468 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGRNO00468 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGRNO00468 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGRNO00468 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGRNO00468 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGRNO00468 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGRNO00468 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AGRNO00468 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AGRNO00468 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGRNO00468 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGRNO00468 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGRNO00468 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AGRNO00468 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGRNO00468 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGRNO00468 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGRNO00468 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGRNO00468 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGRNO00468 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGRNO00468 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGRNO00468 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGRNO00468 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGRNO00468 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGRNO00468 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGRNO00468 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGRNO00468 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGRNO00468 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AGRNO00468 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGRNO00468 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGRNO00468 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGRNO00468 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGRNO00468 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGRNO00468 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGRNO00468 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGRNO00468 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGRNO00468 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGRNO00468 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGRNO00468 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGRNO00468 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGRNO00468 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGRNO00468 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGRNO00468 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGRNO00468 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGRNO00468 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGRNO00468 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGRNO00468 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AGRNO00468 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGRNO00468 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGRNO00468 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGRNO00468 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGRNO00468 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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