Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DFFAO00273 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DFFAO00273 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DFFAO00273 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DFFAO00273 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DFFAO00273 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DFFAO00273 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DFFAO00273 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DFFAO00273 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DFFAO00273 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DFFAO00273 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DFFAO00273 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DFFAO00273 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DFFAO00273 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DFFAO00273 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DFFAO00273 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DFFAO00273 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DFFAO00273 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DFFAO00273 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DFFAO00273 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DFFAO00273 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DFFAO00273 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DFFAO00273 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DFFAO00273 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DFFAO00273 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DFFAO00273 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DFFAO00273 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DFFAO00273 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DFFAO00273 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DFFAO00273 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DFFAO00273 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DFFAO00273 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DFFAO00273 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DFFAO00273 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DFFAO00273 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DFFAO00273 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DFFAO00273 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DFFAO00273 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DFFAO00273 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DFFAO00273 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DFFAO00273 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DFFAO00273 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DFFAO00273 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DFFAO00273 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DFFAO00273 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DFFAO00273 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DFFAO00273 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DFFAO00273 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DFFAO00273 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DFFAO00273 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DFFAO00273 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DFFAO00273 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DFFAO00273 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DFFAO00273 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DFFAO00273 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DFFAO00273 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DFFAO00273 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DFFAO00273 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DFFAO00273 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DFFAO00273 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DFFAO00273 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DFFAO00273 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DFFAO00273 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DFFAO00273 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DFFAO00273 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DFFAO00273 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DFFAO00273 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DFFAO00273 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DFFAO00273 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DFFAO00273 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DFFAO00273 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DFFAO00273 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DFFAO00273 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DFFAO00273 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DFFAO00273 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DFFAO00273 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DFFAO00273 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DFFAO00273 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DFFAO00273 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DFFAO00273 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DFFAO00273 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DFFAO00273 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DFFAO00273 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DFFAO00273 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DFFAO00273 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DFFAO00273 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DFFAO00273 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DFFAO00273 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DFFAO00273 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DFFAO00273 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DFFAO00273 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DFFAO00273 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DFFAO00273 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DFFAO00273 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DFFAO00273 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DFFAO00273 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DFFAO00273 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DFFAO00273 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DFFAO00273 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DFFAO00273 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms