Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3KR12 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3KR12 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3KR12 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3KR12 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KR12 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KR12 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KR12 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KR12 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KR12 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KR12 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KR12 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KR12 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KR12 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KR12 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KR12 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KR12 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KR12 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KR12 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KR12 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KR12 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KR12 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KR12 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KR12 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KR12 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KR12 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KR12 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
J3KR12 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3KR12 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3KR12 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3KR12 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3KR12 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3KR12 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3KR12 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3KR12 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3KR12 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3KR12 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
J3KR12 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3KR12 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3KR12 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3KR12 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3KR12 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3KR12 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3KR12 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3KR12 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
J3KR12 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3KR12 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3KR12 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3KR12 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3KR12 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3KR12 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3KR12 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3KR12 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3KR12 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3KR12 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3KR12 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3KR12 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3KR12 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
J3KR12 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
J3KR12 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3KR12 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3KR12 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3KR12 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3KR12 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3KR12 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3KR12 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3KR12 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3KR12 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3KR12 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3KR12 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3KR12 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3KR12 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3KR12 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3KR12 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3KR12 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3KR12 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3KR12 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3KR12 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3KR12 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3KR12 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3KR12 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3KR12 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3KR12 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3KR12 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3KR12 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3KR12 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3KR12 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3KR12 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3KR12 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3KR12 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3KR12 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3KR12 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
J3KR12 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
J3KR12 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
J3KR12 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
J3KR12 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
J3KR12 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
J3KR12 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
J3KR12 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
J3KR12 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms