Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-1B6SEH8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-1B6SEH8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms