Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF879B4DU55 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms