Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NOTOA8MTQ0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms