Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM200CA6NKL6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM200CA6NKL6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms