Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC69A6NI79 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC69A6NI79 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms