Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRCP1A6NGW2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms