Protein–RNA interactions for Protein: A6NDG6

PGP, Glycerol-3-phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPA6NDG6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGPA6NDG6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PGPA6NDG6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGPA6NDG6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGPA6NDG6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGPA6NDG6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PGPA6NDG6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PGPA6NDG6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGPA6NDG6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGPA6NDG6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PGPA6NDG6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGPA6NDG6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGPA6NDG6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGPA6NDG6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGPA6NDG6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGPA6NDG6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGPA6NDG6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPA6NDG6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPA6NDG6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPA6NDG6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPA6NDG6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPA6NDG6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPA6NDG6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPA6NDG6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPA6NDG6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPA6NDG6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPA6NDG6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPA6NDG6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPA6NDG6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPA6NDG6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PGPA6NDG6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPA6NDG6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPA6NDG6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPA6NDG6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPA6NDG6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPA6NDG6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPA6NDG6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPA6NDG6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPA6NDG6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPA6NDG6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPA6NDG6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPA6NDG6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGPA6NDG6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGPA6NDG6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPA6NDG6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPA6NDG6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPA6NDG6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPA6NDG6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPA6NDG6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPA6NDG6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPA6NDG6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPA6NDG6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPA6NDG6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPA6NDG6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPA6NDG6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPA6NDG6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPA6NDG6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPA6NDG6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPA6NDG6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPA6NDG6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPA6NDG6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPA6NDG6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPA6NDG6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPA6NDG6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPA6NDG6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPA6NDG6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PGPA6NDG6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPA6NDG6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPA6NDG6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPA6NDG6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGPA6NDG6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGPA6NDG6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PGPA6NDG6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PGPA6NDG6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PGPA6NDG6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PGPA6NDG6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PGPA6NDG6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PGPA6NDG6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGPA6NDG6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPA6NDG6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPA6NDG6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPA6NDG6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPA6NDG6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGPA6NDG6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGPA6NDG6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGPA6NDG6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PGPA6NDG6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPA6NDG6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPA6NDG6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPA6NDG6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGPA6NDG6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGPA6NDG6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPA6NDG6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGPA6NDG6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPA6NDG6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGPA6NDG6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPA6NDG6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PGPA6NDG6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PGPA6NDG6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PGPA6NDG6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms