Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP17L4A6NCW7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms