Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms