Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCE3A1L190 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE3A1L190 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms