Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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USP18Q9UMW8 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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USP18Q9UMW8 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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USP18Q9UMW8 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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USP18Q9UMW8 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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USP18Q9UMW8 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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USP18Q9UMW8 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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USP18Q9UMW8 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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