Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FXNQ16595 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FXNQ16595 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FXNQ16595 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FXNQ16595 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FXNQ16595 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FXNQ16595 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FXNQ16595 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FXNQ16595 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FXNQ16595 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FXNQ16595 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FXNQ16595 NDUFB4-201ENST00000184266 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FXNQ16595 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FXNQ16595 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FXNQ16595 GNG3-201ENST00000294117 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
FXNQ16595 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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FXNQ16595 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FXNQ16595 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
FXNQ16595 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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FXNQ16595 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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FXNQ16595 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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FXNQ16595 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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FXNQ16595 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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FXNQ16595 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 SPANXN2-201ENST00000598475 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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